Mario ist verschwunden! ist ein Bildungsspiel und das erste Spiel, in dem Luigi der Hauptprotagonist ist, während Mario eine unterstützende Rolle spielt. Das Hauptspiel besteht darin, sich in einer Stadt seitlich zu bewegen, während man auf Koopas springt, um gestohlene Artefakte zu sammeln. Luigi muss dann die Stadt sichern, indem er diese Artefakte an ihre jeweiligen Orte bringt und zwei Fragen über das Wahrzeichen richtig beantwortet. Die Computer-Version ist ein Point-and-Click-Abenteuerspiel, während die NES- und SNES-Versionen mehr auf Plattformen ausgerichtet sind.
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