Super Mario Maker für den Nintendo 3DS enthält alle Werkzeuge der originalen Wii U-Version, unterstützt jedoch kein Online-Sharing. Stattdessen enthält es 100 Kurse, die von Nintendo entworfen wurden und spezielle Herausforderungen bieten. Neu ist auch die Möglichkeit, lokal an unfertigen Kursen zusammenzuarbeiten.
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