Vs. Dr. Mario ist die Vs. System-Version von Dr. Mario. Das Spiel verzichtet auf den Slow-Modus und verfügt über ein weniger großzügiges Punktesystem. In der NES-Version ist jedes Virus doppelt so viel wert wie das vorherige. In der VS.-Version ist ein Virus nur 200 Punkte mehr wert und nicht doppelt so viele Punkte wie das vorherige Virus.
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